L'ALIMENTATION · ENQUÊTE
Le microbiote
intestinal : vous
n'êtes pas seul·e
dans votre corps.
Il y a tout un écosystème qui vit en vous.
Personne ne vous a envoyé de guide d'accueil.
Vous avez probablement entendu l'affirmation : il y aurait dix fois plus de bactéries dans votre corps que de cellules humaines. C'est l'un des faits les plus répétés dans la vulgarisation scientifique.
C'est aussi faux — et la correction est une bonne première leçon sur comment lire un titre sur le microbiote.
Alors commençons par un vrai décompte.
LE CHIFFRE CÉLÈBRE, CORRIGÉ
Plus proche d'une
égalité que d'un raz-de-marée.
le vrai ratio entre cellules bactériennes et cellules humaines dans votre corps
Pas le fameux 10:1. Un recomptage de 2016 publié dans PLOS Biology a trouvé environ 38 000 milliards de cellules bactériennes contre 30 000 milliards de cellules humaines — presque à égalité, et pesant au total environ 200 grammes.L'essentiel de cette population bactérienne vit dans votre côlon, et ce n'est pas une seule espèce qui fait tout le travail. Un intestin en bonne santé héberge généralement des centaines d'espèces bactériennes différentes, plus un nombre plus modeste d'archées, de champignons et de virus — et la combinaison de chaque personne ne ressemble à aucune autre, même chez des jumeaux identiques.
Se tromper sur le ratio ne rend pas le microbiote moins intéressant. Si quelque chose, « à peu près à égalité avec vous, cellule pour cellule » est le fait le plus étrange des deux.
CE QU'ILS PRODUISENT EN ÉCHANGE
La fermentation, ce n'est pas qu'un mot pour yaourt.
Les acides gras à chaîne courte — acétate, propionate et butyrate — produits par la fermentation des fibres. Ensemble, ils fournissent environ 5 à 15 % de vos calories quotidiennes.
Certaines bactéries intestinales synthétisent de la vitamine K et plusieurs vitamines B, un apport modeste mais réel en complément de celui de l'alimentation.
Hydrogène, méthane et dioxyde de carbone — le sous-produit peu glorieux, et parfaitement normal, d'une colonie bien nourrie.
Des fibres à l'entrée.
Du carburant à la sortie.
Parmi les trois acides gras à chaîne courte, le butyrate attire le plus l'attention, à juste titre : c'est le carburant préféré des cellules qui tapissent votre côlon, fournissant jusqu'à 90 % de leurs besoins énergétiques.
Ces cellules du côlon, à leur tour, entretiennent la paroi intestinale, produisent le mucus protecteur, et aident à réguler l'inflammation localement. Une colonie privée de fibres produit moins de butyrate — l'une des raisons les plus concrètes et mécanistiques pour lesquelles les régimes pauvres en fibres sont liés à une moins bonne santé intestinale, plutôt qu'une simple corrélation sans « pourquoi » clair.
Différentes fibres nourrissent différentes bactéries et produisent différents ratios de ces acides — ce qui explique en partie pourquoi « manger une variété de végétaux » vaut mieux qu'« un seul supplément de fibres ».
Ce n'est pas juste
une question de digestion.
Sauf que, un peu quand même.
Au-delà de la fermentation des fibres, le microbiote joue un vrai rôle dans la digestion au quotidien : il aide à réguler la motilité intestinale (la vitesse à laquelle les choses circulent en vous), soutient la couche de mucus qui protège la paroi intestinale, et entraîne une grande partie de votre système immunitaire — une quantité impressionnante de tissu immunitaire se trouve directement autour de l'intestin, supervisée par, et supervisant, les bactéries qui y vivent.
C'est aussi pourquoi les antibiotiques peuvent laisser des symptômes digestifs qui durent plus longtemps que l'infection qu'ils traitaient : une cure d'antibiotiques ne se contente pas d'éliminer les mauvaises bactéries, elle perturbe toute la communauté résidente, et reconstruire cette diversité peut prendre des semaines.
CE QU'ON SAIT VRAIMENT
La preuve la plus solide n'a rien de subtil.
La plupart des recherches sur le microbiote sont corrélationnelles — intéressantes, mais difficiles à établir comme cause à effet. Un domaine fait vraiment exception.
Le Clostridioides difficile est une infection intestinale qui peut s'installer après que des antibiotiques ont éliminé la communauté bactérienne normale d'une personne, et qui peut devenir dangereusement récurrente. Le traitement antibiotique standard ne guérit une première récidive qu'environ un quart à un tiers du temps.
L'essai a été arrêté prématurément parce que la différence était trop importante pour continuer, de façon éthique, à recruter des patients dans le groupe antibiotiques seuls. C'est à peu près ce que la science du microbiote a de plus proche d'une victoire totale : restaurez la communauté bactérienne, et la maladie que cette communauté supprimait ne revient tout simplement pas.
C'est aussi un bon étalon pour tout le reste de ce qu'on raconte sur le microbiote — dont la plupart n'est pas soutenu par des preuves aussi solides.
LA QUESTION QUE J'ÉTAIS VENUE POSER
D'accord, mais devrais-je
acheter un test du microbiote ?
Donc le microbiote est réel, il a une vraie influence, et dans au moins un cas, les preuves pour intervenir sont aussi solides que la médecine peut l'être.
Ce qui nous amène à l'industrie qui s'est développée autour de tout ça.
L'argument semble précis.
La science n'y est pas encore.
La logique derrière les tests de microbiote à domicile est séduisante :
Il n'existe pas de référence établie pour ce à quoi ressemble un microbiote « en bonne santé » — ça varie énormément entre personnes en bonne santé. Les tests commerciaux ont aussi montré une mauvaise reproductibilité : envoyer le même échantillon à différentes entreprises, ou à la même entreprise deux fois, ne renvoie pas de façon fiable le même résultat.
Ça ne rend pas la science sous-jacente fausse. Ça rend le saut entre « voici votre profil bactérien » et « donc mangez précisément ces aliments » beaucoup plus fragile que ce que l'emballage laisse penser.
LE CONTEXTE COMPTE
Alors, quand le microbiote mérite-t-il une vraie attention ?
Une infection récurrente à C. difficile, pour laquelle la transplantation fécale est un traitement établi et soutenu par les preuves
Un syndrome de l'intestin irritable ou une MICI diagnostiqués, sous le suivi d'un gastro-entérologue
Des symptômes digestifs suite à une cure d'antibiotiques
Une alimentation réellement pauvre en variété de fibres, indépendamment de tout résultat de test
La question la moins utile est :
« Que dit mon rapport de microbiote sur ce que je devrais manger ? »La plus utile est :
« Est-ce que je nourris vraiment cet écosystème avec une variété de fibres, indépendamment de ce qu'un test prétend montrer ? »TROIS MYTHES, RETIRÉS
Ce que la culture bien-être a étiré au-delà des preuves.
LE MYTHE
« Le syndrome de l'intestin perméable empoisonne tout votre corps. »
LES PREUVES
L'augmentation de la perméabilité intestinale est réelle et mesurable, et elle apparaît dans certaines maladies comme la cœliaquie et la maladie de Crohn. Mais le « syndrome de l'intestin perméable » en tant que diagnostic autonome, causant tout, du brouillard mental aux problèmes de peau, n'est pas une maladie médicalement reconnue — et il n'existe aucun test validé pour le diagnostiquer.
LE MYTHE
« Un complément probiotique va réparer ma santé intestinale. »
LES PREUVES
Certaines souches précises, pour des situations précises — comme prévenir la diarrhée liée aux antibiotiques — ont de vraies preuves à l'appui. « Les probiotiques » comme achat bien-être générique pour une personne par ailleurs en bonne santé reposent sur des preuves bien plus minces que ce que le rayon de compléments laisse entendre.
LE MYTHE
« Il faut détoxifier ou réinitialiser son intestin. »
LES PREUVES
Votre foie et vos reins font déjà ça, en continu, sans cure de jus. Ce qui modifie vraiment la composition du microbiote dans les études, c'est un changement alimentaire durable — plus de variété de fibres, jour après jour — pas une « réinitialisation » courte et spectaculaire.
ALORS, QU'EST-CE QUE J'AI RÉELLEMENT APPRIS ?
Vos colocataires intestinaux n'ont probablement pas besoin
de ces compléments hors de prix.
Je m'attendais soit à un argumentaire bien-être, soit à un démontage complet. Ce que j'ai trouvé était plus intéressant que les deux : un écosystème vraiment vaste, vraiment influent, une preuve causale spectaculaire de son importance, et toute une industrie qui a pris plusieurs longueurs d'avance sur ce que le reste des preuves peut réellement soutenir.
Nourrissez-le de fibres, et de fibres variées — c'est le seul conseil avec un vrai mécanisme derrière lui.
Traitez les affirmations sur le « microbiote » sur un spectre, du solide comme la transplantation fécale à la fiction du thé détox.
Un résultat de test n'est pas un diagnostic, et un complément ne remplace pas l'alimentation qui façonne réellement cet écosystème au quotidien.
Pas un coup marketing.
Pas un organe mystique avec des opinions sur votre mode de vie.
Juste un écosystème, à peu près de votre taille, qui fait un travail réellement essentiel.
ET C'EST PEUT-ÊTRE ÇA, LE PLUS IMPORTANT
Comprendre nous permet
de poser de meilleures questions.
Je ne pense pas que la leçon du microbiote soit qu'il faut cartographier ses propres bactéries avant de décider quoi manger ce soir.
Je pense plutôt que le conseil le plus fiable était le moins exotique — la variété et les fibres — caché à la vue de tous sous beaucoup de science qui sonne vraiment impressionnante.
« Qu'est-ce que mes bactéries intestinales veulent que j'achète ? »
devient« Est-ce que je mange une gamme vraiment variée de végétaux cette semaine ? »
« Cette affirmation est-elle plus proche de l'essai sur la transplantation fécale, ou plus proche d'un thé détox ? »
« Ai-je vraiment une raison diagnostiquée d'intervenir, ou juste de la curiosité ? »
Et si la réponse honnête est « surtout de la curiosité » ?
Parce que la nutrition est censée exister dans notre vie.
Pas devenir un deuxième travail à gérer un écosystème invisible, sur les conseils d'une entreprise qui vous a envoyé un tube par la poste.
Je suis arrivée ici en m'attendant soit à avoir peur de mon propre intestin, soit à être convaincue par un complément. J'en repars avec une liste de courses plus longue en végétaux, et une bonne dose de scepticisme envers tout ce qui promet de « réinitialiser » ce qui n'a jamais vraiment été cassé.
Et les plusieurs milliers de milliards de petits colocataires avec qui vous le faites.
LISEZ LES DONNÉES SCIENTIFIQUES
Sources
- Sender, R., Fuchs, S., & Milo, R. (2016). Revised Estimates for the Number of Human and Bacteria Cells in the Body. PLOS Biology.
- Koh, A., De Vadder, F., Kovatcheva-Datchary, P., & Bäckhed, F. (2016). From Dietary Fiber to Host Physiology: Short-Chain Fatty Acids as Key Bacterial Metabolites. Cell.
- van Nood, E., et al. (2013). Duodenal Infusion of Donor Feces for Recurrent Clostridium difficile. New England Journal of Medicine.
- Camilleri, M. (2019). Leaky Gut: Mechanisms, Measurement and Clinical Implications in Humans. Gut.
- National Center for Complementary and Integrative Health (NIH). Probiotics: What You Need To Know.
- Walter, J., & Ley, R. (2011). The Human Gut Microbiome: Ecology and Recent Evolutionary Changes. Annual Review of Microbiology.